Some improvements to the Erik+2 method for unbalanced partitions

Autors/ores

  • Oscar Rivero Salgado Universitat Politècnica de Catalunya
  • Pol Torrent i Soler Universitat Politècnica de Catalunya

Paraules clau:

Phylogenetics, Flattening matrix, Erik 2 Method

Resum

En aquest article proposem millores al mètode Erik+2, que s'empra per obtenir la distribució de les espècies a les fulles d'un arbre filogenètic, suggerint solucions als problemes provocats per la falta de dades experimentals quan es tracta amb un nombre elevat d'espècies. Presentem una nova tècnica per calcular les puntuacions assignades a cada distribució que es basa en aplicar successivament el mètode Erik+2 tenint en compte les files i columnes més plenes de la matriu de dades observades i compensant les puntuacions obtingudes per files i per columnes segons les dimensions de la matriu. Segons aquestes dimensions també proposem normalitzacions de les puntuacions obtingudes.

Biografia de l'autor/a

Oscar Rivero Salgado, Universitat Politècnica de Catalunya




Descàrregues

Publicat

2016-04-19

Com citar

Rivero Salgado, O., & Torrent i Soler, P. (2016). Some improvements to the Erik+2 method for unbalanced partitions. Reports@SCM, 2(1), 11–20. Retrieved from https://revistes.iec.cat/index.php/reports/article/view/139174

Número

Vol. 2 Núm. 1 (2016)

Secció

Articles

Llicència

The intellectual property of articles belongs to the respective authors.
On submitting articles for publication to the journal Reports@SCM, authors accept the following terms:
  1. Authors assign to Societat Catalana de Matemàtiques (a subsidiary of Institut d’Estudis Catalans) the rights of reproduction, communication to the public and distribution of the articles submitted for publication to Reports@SCM.
  2. Authors answer to Societat Catalana de Matemàtiques for the authorship and originality of submitted articles.
  3. Authors are responsible for obtaining permission for the reproduction of all graphic material included in articles.
  4. Societat Catalana de Matemàtiques declines all liability for the possible infringement of intellectual property rights by authors.
  5. The contents published in the journal, unless otherwise stated in the text or in the graphic material, are subject to a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs (by-nc-nd) 3.0 Spain licence, the complete text of which may be found at https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/deed.en. Consequently, the general public is authorised to reproduce, distribute and communicate the work, provided that its authorship and the body publishing it are acknowledged, and that no commercial use and no derivative works are made of it.
  6. The journal Reports@SCM is not responsible for the ideas and opinions expressed by the authors of the published articles.